In Space Pioneers kann man sich ab einem bestimmten Zeitpunkt für zwei Spielerzweige entscheiden, die den Fortlauf des Spiels maßgeblich beeinflussen. Ab dem Bau eines Forschungslabors der Stufe 2 (Galaxie 5-9 und 667) bzw. der Stufe 3 (Galaxie 0-4 und 666) kann ein Spieler sich entscheiden, ob er zukünftig als Händler oder Krieger agieren möchte. Diese Zweig-Entscheidung war lange Zeit eine verbindliche Wahl, allerdings wurde der sogenannte Zweigwechsel eingeführt. Seitdem kann man für 300 Premiumpunkte seine Entscheidung revidieren, falls man mit ihr unzufrieden ist. In der Rangliste steht hinter dem Namen die Zweig-Angabe Krieger oder Händler. Falls die Angabe fehlt, bedeutet dies, dass der Spieler noch nicht fortgeschritten genug ist, um sich für eine der beiden Zweige zu entscheiden, oder diese Entscheidung noch nicht getroffen hat.
Die Wahl des Zweiges sollte wohl bedacht werden. Es ist aufwändig und teuer, den Zweig zu wechseln.Händlern und Kriegern stehen im weiteren Verlauf des Spieles unterschiedliche Spezialgebäude, Spezialschiffe und Forschungen zur Verfügung, auf die der andere Berufszweig verzichten muss.
Spezialfall: Kriegerischer Händler
